More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0862 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 438 aa  867    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  63.72 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  62.59 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  64.32 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  63.86 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  63.41 
 
 		 441 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  63.64 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  63.86 
 
 		 441 aa  526  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  53.85 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  53.99 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  55.73 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  55.2 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  50.8 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  52.6 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  51.23 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  48.07 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  49.78 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  48.29 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  51.17 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  48.29 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  50.35 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  48.51 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.82 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  47.72 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.47 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  46.92 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.39 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  47.36 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  48.54 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  47.93 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  47.93 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  46.08 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  48.05 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  48.6 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.76 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.22 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.23 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  44.6 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  45.15 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  45.94 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  44.73 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  46.42 
 
 		 439 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  43.47 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  46.1 
 
 		 429 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  47.2 
 
 		 421 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  46.06 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  45.6 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.24 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  45.08 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  45.98 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  45.75 
 
 		 446 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  45.98 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  45.29 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  44.09 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  45.43 
 
 		 437 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  45.81 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  47.51 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  45.41 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  44.49 
 
 		 445 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  44.8 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  43.97 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  45.71 
 
 		 448 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  46.08 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  46.17 
 
 		 444 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  45.87 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  43.12 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 		 435 aa  359  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  44.03 
 
 		 457 aa  358  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  48.51 
 
 		 435 aa  358  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  45.23 
 
 		 445 aa  358  9e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  43.42 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  45.31 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  44.55 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  46.26 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  45.06 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 		 453 aa  356  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.85 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.1 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>