More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3142 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 440 aa  879    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  57.69 
 
 		 437 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  57.79 
 
 		 439 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  56.42 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  55.15 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  53.14 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  52.64 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  50.8 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  50.68 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  49.44 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  48.51 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  47.85 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  47.5 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  47.39 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  48.3 
 
 		 441 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  47.62 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  47.62 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.69 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.5 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 420 aa  343  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.43 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  41.16 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  39.69 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.15 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  40.5 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.27 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.07 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.32 
 
 		 443 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  40.53 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  40.5 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  41.38 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  41.51 
 
 		 447 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  41.51 
 
 		 447 aa  323  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  40.98 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  38.71 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.4 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  39.49 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  41.42 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  37.34 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  38.95 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  41.42 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.14 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 446 aa  320  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  40.8 
 
 		 421 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.32 
 
 		 446 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  41.51 
 
 		 447 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.96 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  39.86 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.18 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  40.41 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  39.68 
 
 		 448 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  41.78 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  41.77 
 
 		 419 aa  316  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 443 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.74 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  40.92 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  40.9 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  41.15 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  39.5 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.13 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  41.42 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  38.58 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  40.96 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  39.16 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  38.44 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  40.73 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  40.87 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  37.7 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 		 446 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  40.05 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  40.62 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  39.95 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  38.78 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  37.78 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  38.59 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  39.55 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  38.72 
 
 		 432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  39.45 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  40.64 
 
 		 446 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  38.71 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>