More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1046 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  71.62 
 
 
441 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  85.17 
 
 
445 aa  774    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
441 aa  877    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
441 aa  877    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  85.71 
 
 
441 aa  773    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
441 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  85.17 
 
 
445 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  68.93 
 
 
436 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  69.68 
 
 
439 aa  627  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  68.03 
 
 
435 aa  614  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  66.44 
 
 
436 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  64.88 
 
 
445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  62.86 
 
 
441 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  62.64 
 
 
441 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  62.59 
 
 
430 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  61.68 
 
 
430 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  60.5 
 
 
438 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  59.82 
 
 
432 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  59.78 
 
 
437 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  59.82 
 
 
437 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  60.63 
 
 
431 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  57.56 
 
 
437 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  60.77 
 
 
436 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  60.27 
 
 
435 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  60.32 
 
 
436 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  57.65 
 
 
442 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  59.4 
 
 
457 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  59.5 
 
 
432 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  60.22 
 
 
438 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  57.34 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  57.56 
 
 
429 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.58 
 
 
439 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  54.52 
 
 
434 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  56.25 
 
 
436 aa  478  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  56.24 
 
 
448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  54.95 
 
 
435 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  50.22 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  50.34 
 
 
445 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  52.86 
 
 
449 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  49.66 
 
 
447 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  44.74 
 
 
431 aa  395  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  47.39 
 
 
423 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 
447 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.44 
 
 
420 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 
445 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 
447 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.43 
 
 
428 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  46.46 
 
 
421 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.84 
 
 
447 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.07 
 
 
424 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  47.09 
 
 
435 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  46.24 
 
 
448 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 
437 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.82 
 
 
438 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 
429 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  46.46 
 
 
429 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  45.01 
 
 
435 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  44.42 
 
 
427 aa  360  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 
426 aa  359  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.68 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.72 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.05 
 
 
418 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  43.5 
 
 
422 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  45.29 
 
 
419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  45.41 
 
 
426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  42.26 
 
 
430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.32 
 
 
442 aa  352  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 
435 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.71 
 
 
449 aa  349  7e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 
435 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.34 
 
 
463 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 
443 aa  346  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 
443 aa  346  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 
421 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 
435 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  42.16 
 
 
435 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  41.34 
 
 
500 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 
443 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.11 
 
 
435 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  45.12 
 
 
437 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 
443 aa  342  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 
446 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.89 
 
 
446 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.54 
 
 
445 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42.08 
 
 
443 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  43.27 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 
448 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
437 aa  340  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  42.57 
 
 
443 aa  339  5e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  41.99 
 
 
444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 
435 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
452 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.05 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.45 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.4 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  42.04 
 
 
430 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  42.67 
 
 
440 aa  336  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 
441 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 
441 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>