More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0131 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  71.23 
 
 
434 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  71.23 
 
 
434 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  76.39 
 
 
433 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  71.69 
 
 
434 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  76.39 
 
 
433 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  71 
 
 
434 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  76.39 
 
 
433 aa  677    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  71.46 
 
 
434 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  76.39 
 
 
433 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  71.69 
 
 
434 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  71.23 
 
 
434 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  76.62 
 
 
433 aa  679    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  76.39 
 
 
433 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  71 
 
 
434 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  71.93 
 
 
434 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  77.31 
 
 
433 aa  656    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
430 aa  854    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  76.62 
 
 
433 aa  679    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  76.39 
 
 
433 aa  677    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  76.62 
 
 
433 aa  679    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  92.33 
 
 
430 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  71.46 
 
 
434 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  71.93 
 
 
434 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  73.55 
 
 
355 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  59.3 
 
 
430 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  59.3 
 
 
430 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  58.33 
 
 
430 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 
434 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  50.57 
 
 
438 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  49.43 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  49.07 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  50.81 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  49.43 
 
 
430 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 
424 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  49.2 
 
 
429 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  51.51 
 
 
419 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
419 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 
421 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  48.41 
 
 
435 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  48.28 
 
 
431 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  50.6 
 
 
419 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.62 
 
 
447 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  48.16 
 
 
421 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
418 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  48.39 
 
 
447 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.45 
 
 
444 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.28 
 
 
447 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  46.36 
 
 
430 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.67 
 
 
448 aa  360  4e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
435 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.54 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  44.57 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 
435 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.03 
 
 
445 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.42 
 
 
427 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  43.81 
 
 
426 aa  355  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.73 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 
435 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.48 
 
 
437 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 
435 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 
435 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.43 
 
 
438 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  49.21 
 
 
422 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 
436 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.03 
 
 
437 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
437 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 
448 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.84 
 
 
428 aa  345  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 
446 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  43.75 
 
 
444 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  43.21 
 
 
436 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  43.33 
 
 
442 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 
443 aa  343  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 
428 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 
437 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 
441 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 
443 aa  341  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.43 
 
 
463 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  42.21 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  43.9 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.96 
 
 
446 aa  339  5e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  44.58 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  41.69 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  42.33 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  43.02 
 
 
444 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  41.78 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 
446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 
428 aa  336  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 
446 aa  336  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
425 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 
446 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 
443 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  42.49 
 
 
446 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  44.49 
 
 
433 aa  335  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>