More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_436 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  98.86 
 
 		 438 aa  864    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 438 aa  874    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  96.35 
 
 		 438 aa  847    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  51.69 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  49.67 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  49.45 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  48.33 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3004  preprotein translocase, SecY subunit  50.22 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339766  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 		 418 aa  325  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  39.26 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 		 420 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  42.21 
 
 		 427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.86 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  41.24 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  42.3 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 		 447 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  40.53 
 
 		 448 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  40.82 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.04 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  39.77 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  41.38 
 
 		 446 aa  296  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  41.38 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  38.67 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.89 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  39.2 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  37.86 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 		 430 aa  293  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  39.69 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  39.46 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.51 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  39.43 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  39.78 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  39.78 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  39.78 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  37.16 
 
 		 425 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.88 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  39.15 
 
 		 441 aa  288  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  38.92 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  38.95 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  37.53 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  38.03 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  39.68 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  38.88 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  38.5 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  39.15 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  41.74 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 		 446 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  40.98 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  39.15 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  38.41 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  38.1 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  39.17 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 		 441 aa  285  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  38.78 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  40.6 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  39.55 
 
 		 428 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  40.6 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.02 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  39.96 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  39.73 
 
 		 423 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  37.87 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  38.32 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  40.49 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  38.58 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  39.15 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  40.58 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  40.94 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  38.36 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  41.3 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  39.36 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.24 
 
 		 443 aa  279  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.12 
 
 		 437 aa  279  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  37.41 
 
 		 435 aa  279  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  37.9 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  39.45 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.63 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>