More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0555 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  81.42 
 
 
479 aa  800    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
477 aa  949    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  84.7 
 
 
477 aa  825    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  71.88 
 
 
479 aa  714    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  78.62 
 
 
477 aa  784    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  56.42 
 
 
492 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  56.59 
 
 
492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  54.19 
 
 
492 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  54.67 
 
 
489 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  51 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  49.34 
 
 
537 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  51.59 
 
 
504 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  51.01 
 
 
491 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  40.66 
 
 
599 aa  364  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  37.18 
 
 
442 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  36.97 
 
 
442 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  37.18 
 
 
442 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  36.51 
 
 
443 aa  286  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  35.55 
 
 
443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  32.03 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  29.98 
 
 
559 aa  216  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  29.1 
 
 
463 aa  207  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  30.02 
 
 
476 aa  206  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  29.86 
 
 
476 aa  203  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  28.74 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  28.63 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  28.36 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.35 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 
460 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  27.07 
 
 
459 aa  168  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.82 
 
 
465 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.67 
 
 
482 aa  153  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  26.92 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  23.84 
 
 
501 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.93 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  22.88 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.8 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.67 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  22.81 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  23.27 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23.46 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  23.77 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  22.81 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  23.9 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  22.63 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.33 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  24.03 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  23.79 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  24.64 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  24.74 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  23.45 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  22.62 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  23.22 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  24.27 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 
437 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  21.7 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  22.88 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  24.03 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  24.14 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  24.53 
 
 
421 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  23.64 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  24.09 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  24.68 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  23.83 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  23.46 
 
 
438 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  24.47 
 
 
421 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.73 
 
 
435 aa  63.9  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  24.47 
 
 
421 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  23.66 
 
 
445 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 
436 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  22.24 
 
 
430 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  23.33 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  24.59 
 
 
421 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  24.54 
 
 
471 aa  62.8  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  22.98 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  23.08 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  21.53 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  22.62 
 
 
442 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  24.12 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  22.76 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  22.98 
 
 
435 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  22.62 
 
 
442 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  22.72 
 
 
450 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  23.16 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  24.89 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  25.47 
 
 
446 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  21.29 
 
 
434 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  22.14 
 
 
440 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  24.42 
 
 
446 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  21.51 
 
 
434 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  23.22 
 
 
435 aa  60.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  22.65 
 
 
442 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  24.64 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  22.61 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  23.21 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  24.42 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  24.04 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>