141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1407 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  74.94 
 
 		 442 aa  669    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  74.27 
 
 		 443 aa  663    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 443 aa  876    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  74.94 
 
 		 442 aa  685    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  74.94 
 
 		 442 aa  673    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  38.67 
 
 		 479 aa  310  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  38.45 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  37.14 
 
 		 479 aa  299  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  36.19 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.53 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  37.37 
 
 		 477 aa  289  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  37.71 
 
 		 559 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  35.55 
 
 		 477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  37.08 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  38.17 
 
 		 489 aa  280  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  36.33 
 
 		 599 aa  279  8e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  37.42 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  37.17 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  35.36 
 
 		 478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 		 492 aa  272  9e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  35.54 
 
 		 537 aa  263  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  35.55 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  38.62 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  37.53 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  33.55 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  33.48 
 
 		 478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  33.26 
 
 		 469 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  32.11 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  31.21 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  31.42 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.57 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  30.82 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  29.2 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  27.14 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23.98 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  25.06 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  23.38 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  23.38 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  23.38 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  26.85 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  23.75 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  22.55 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.14 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  24.94 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  20.81 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  22.1 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  24.74 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.74 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.27 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  23.01 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.7 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  23.83 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  21.47 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  21.47 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.94 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  24.44 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  25 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  22.73 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  25.72 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  23.73 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  24.46 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  23.8 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  22.43 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  24.4 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.04 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  26.36 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.79 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  24.66 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.92 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  24.14 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  24.14 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  23.45 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1554  preprotein translocase, SecY subunit  28.57 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0492066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  25.4 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  20 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  24.02 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  22.69 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.34 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  25.4 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  24.06 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  22.86 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  22.64 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.25 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  26.2 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  24.47 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  23.03 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  26.48 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>