More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0797 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
457 aa  907    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  45.66 
 
 
435 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
420 aa  352  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.32 
 
 
500 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.25 
 
 
435 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.05 
 
 
428 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 
435 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.05 
 
 
437 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 
443 aa  346  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  41.63 
 
 
429 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 
445 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.48 
 
 
435 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 
435 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  40.13 
 
 
438 aa  340  4e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.6 
 
 
437 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.88 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.91 
 
 
419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  39 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  40.04 
 
 
437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  40.43 
 
 
441 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.76 
 
 
442 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  40.04 
 
 
444 aa  335  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  39.13 
 
 
443 aa  333  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  39.47 
 
 
443 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  39.22 
 
 
443 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  38.78 
 
 
437 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.34 
 
 
437 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 
441 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  38.95 
 
 
447 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  40.54 
 
 
447 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  40.54 
 
 
447 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  39.87 
 
 
448 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  41.85 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 
421 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 
443 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 
443 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 
437 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  39.96 
 
 
443 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  43.11 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  41.74 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  40.22 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  42.42 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  40.57 
 
 
435 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.35 
 
 
435 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  39.65 
 
 
430 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  39.78 
 
 
440 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.4 
 
 
429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  41.43 
 
 
437 aa  319  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  41.05 
 
 
436 aa  319  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  39.87 
 
 
446 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  41.07 
 
 
443 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  41.37 
 
 
431 aa  317  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 
437 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  40.57 
 
 
441 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.22 
 
 
419 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  39.51 
 
 
419 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  41.15 
 
 
429 aa  316  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 
430 aa  316  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  41.14 
 
 
441 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  40.58 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  38.75 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  38.62 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  39.87 
 
 
421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  37.34 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  36.88 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 
453 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 
418 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  39.42 
 
 
442 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  41.05 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  40.31 
 
 
441 aa  312  9e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  39.6 
 
 
440 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.04 
 
 
443 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  40 
 
 
432 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  38.14 
 
 
452 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  40.53 
 
 
435 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  37.92 
 
 
452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  39.11 
 
 
443 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  41.07 
 
 
435 aa  310  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  40.58 
 
 
422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  38.89 
 
 
442 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  38.89 
 
 
442 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  39.39 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.53 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  39.42 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  39.87 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  39.91 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  39.42 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  39.2 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  38.98 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  38.75 
 
 
448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  38.98 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  39.2 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  38.98 
 
 
444 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  39.06 
 
 
434 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  38.98 
 
 
444 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  38.89 
 
 
452 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  39.11 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  40.49 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>