143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1705 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 537 aa  1053    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  61.86 
 
 		 492 aa  630  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  63.07 
 
 		 492 aa  609  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  51.33 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  49.25 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  50.95 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  49.72 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  49.34 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  49.72 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  48.88 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  49.53 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  48.04 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  40.73 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  37.17 
 
 		 442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  36.29 
 
 		 443 aa  299  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  36.52 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  37.17 
 
 		 442 aa  296  9e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  36.79 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  32.09 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  30.49 
 
 		 478 aa  207  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  29.25 
 
 		 559 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  31.59 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  28.57 
 
 		 469 aa  203  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  29.64 
 
 		 476 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  29.6 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.51 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  34.11 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.46 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  26.06 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  29.55 
 
 		 455 aa  107  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27.36 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  29.06 
 
 		 501 aa  100  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  26.37 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  23.93 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  23.61 
 
 		 450 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  23.28 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  20.98 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  22.71 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  25.17 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  27.7 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  25.17 
 
 		 420 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  23.93 
 
 		 439 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  27.51 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  24.05 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  25.16 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  24.41 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  24.2 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  28.04 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  24.41 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  28.49 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  28.05 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  23.68 
 
 		 430 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  25.17 
 
 		 443 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  27.66 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  25.5 
 
 		 421 aa  50.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  24.85 
 
 		 500 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  27.51 
 
 		 443 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23 
 
 		 437 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  25.17 
 
 		 421 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  24.36 
 
 		 427 aa  50.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  22.43 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  27.51 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  26.64 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  24.83 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  27.27 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  24.83 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  25.17 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  23.08 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  24.83 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  23.86 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  19.8 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  22.19 
 
 		 437 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  25.89 
 
 		 436 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  24.29 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  26.55 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  23.15 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  23.79 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  27.51 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  22.3 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  25.46 
 
 		 434 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  21.2 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  24.05 
 
 		 446 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1554  preprotein translocase, SecY subunit  23.79 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0492066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  26.6 
 
 		 443 aa  47.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  25.49 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  25.49 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  25.49 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  21.55 
 
 		 429 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 418 aa  47.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  26.57 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.19 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  31.53 
 
 		 456 aa  47.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23.17 
 
 		 445 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.05 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  21.9 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  22.64 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  22.46 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0509  preprotein translocase subunit SecY  28.21 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  23.75 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>