More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0418 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 431 aa  846    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  49.1 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  47.75 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  47.23 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  49.32 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  46.01 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  47.95 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  46.82 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  46.55 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  47.71 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  48.19 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  45.91 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  49.41 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  46.46 
 
 		 445 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  46.42 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  47.36 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  47.73 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  42.92 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  45.48 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  46.24 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.77 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  44.06 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  46.28 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  46.54 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.37 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.85 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  45.75 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  45.77 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  45.54 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  42.92 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  45.1 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  46.91 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.55 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.53 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 		 420 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.34 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  44.54 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  41.08 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.08 
 
 		 442 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.89 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.43 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  41.15 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.27 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.71 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.09 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.6 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.3 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.21 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  41.32 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  41.48 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 421 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  39.77 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  40.6 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  40.61 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  40.77 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  40.81 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  38.94 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  38.81 
 
 		 422 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 446 aa  312  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  39.41 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  40.35 
 
 		 434 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  38.9 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  39.68 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  39.41 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  39.68 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  39.08 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.41 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.06 
 
 		 445 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  41.88 
 
 		 431 aa  310  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  39.27 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>