More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1727 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 445 aa  901    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  83.15 
 
 		 447 aa  769    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  59.45 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  59.4 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  59.16 
 
 		 432 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.4 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  59.36 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  57.01 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  55.89 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  53.86 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  53.9 
 
 		 437 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  55.15 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  51.9 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  54.36 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  51.45 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  51.03 
 
 		 438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  51.26 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  52.26 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  51.01 
 
 		 441 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  50.68 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  53.42 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  51.92 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  51.25 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  51.48 
 
 		 436 aa  435  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  50.67 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  49.23 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  49.21 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  49.54 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  51.38 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  50.79 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  52.13 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.55 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  50.89 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  45.52 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  43.74 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.28 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  45.06 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.11 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.07 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.7 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.83 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.27 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.53 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.27 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.82 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  41.91 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.67 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 445 aa  332  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  42.57 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.43 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  42.59 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  41.93 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 		 446 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  42.63 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  40.32 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.99 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  40.32 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.33 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.78 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 437 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.35 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  40.67 
 
 		 426 aa  325  8.000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.32 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  42.26 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.53 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.53 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  40.5 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  41.47 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.32 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.43 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  42.52 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  43.16 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  43.16 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>