More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2668 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
436 aa  866    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  95.41 
 
 
436 aa  816    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  70.78 
 
 
438 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  67.89 
 
 
435 aa  594  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  67.05 
 
 
429 aa  588  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  66.06 
 
 
437 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  65.53 
 
 
431 aa  581  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  62.84 
 
 
434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  67.2 
 
 
432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  64.09 
 
 
429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  63.1 
 
 
438 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  64.32 
 
 
436 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  64.76 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  63.55 
 
 
435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  66.29 
 
 
436 aa  559  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  64.24 
 
 
430 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.82 
 
 
434 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  61.82 
 
 
439 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  62.79 
 
 
436 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  63.06 
 
 
441 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  63.29 
 
 
441 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  60.22 
 
 
437 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  61.45 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  61.45 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  61.45 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  60.09 
 
 
441 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  61.69 
 
 
445 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  60.91 
 
 
437 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  60.68 
 
 
432 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  60.27 
 
 
441 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  60.82 
 
 
435 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  60.86 
 
 
439 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  61.69 
 
 
445 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  58.65 
 
 
442 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  58.88 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  60.75 
 
 
448 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  55.77 
 
 
457 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  56.86 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  54.13 
 
 
447 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  54.36 
 
 
445 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  48.05 
 
 
423 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  46.4 
 
 
427 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.16 
 
 
445 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.5 
 
 
435 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 
447 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 
447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  46.24 
 
 
431 aa  377  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.73 
 
 
447 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 
435 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 
435 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 
435 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 
420 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  46.05 
 
 
448 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 
435 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  44.3 
 
 
426 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.9 
 
 
428 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.91 
 
 
429 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 
437 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 
435 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.42 
 
 
463 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  43.64 
 
 
426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 
421 aa  356  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.76 
 
 
442 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 
443 aa  353  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  42.5 
 
 
448 aa  352  8.999999999999999e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 
443 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  43.53 
 
 
430 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 
444 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  44.83 
 
 
443 aa  350  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 
429 aa  351  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 
435 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
435 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  44.49 
 
 
422 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 
424 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.58 
 
 
419 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.92 
 
 
449 aa  346  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  44.7 
 
 
426 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 
435 aa  346  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  45.35 
 
 
431 aa  345  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.21 
 
 
438 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 
419 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.57 
 
 
418 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.15 
 
 
445 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 
437 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  44.04 
 
 
446 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 
437 aa  342  9e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  44.16 
 
 
448 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 
443 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  41.1 
 
 
500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42.05 
 
 
448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 
443 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 
443 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  43.44 
 
 
444 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 
437 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  42.7 
 
 
433 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.23 
 
 
441 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 
441 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.59 
 
 
446 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>