More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2994 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  74.89 
 
 
436 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
446 aa  874    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  68.44 
 
 
439 aa  624  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  70.69 
 
 
437 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  70.69 
 
 
437 aa  618  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  70.54 
 
 
438 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  70.54 
 
 
438 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  71.18 
 
 
439 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  59.47 
 
 
439 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  61.25 
 
 
439 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  60.36 
 
 
439 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  60.36 
 
 
439 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  61.02 
 
 
439 aa  474  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  61.02 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  59.02 
 
 
439 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  58.13 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  58.13 
 
 
439 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  57.91 
 
 
439 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.57 
 
 
447 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.92 
 
 
445 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.34 
 
 
447 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.93 
 
 
429 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.81 
 
 
447 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 
435 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.48 
 
 
435 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.91 
 
 
446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 
435 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.38 
 
 
435 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.33 
 
 
442 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
437 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 
437 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.27 
 
 
438 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.38 
 
 
446 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 
446 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 
446 aa  342  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  43.35 
 
 
424 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 
443 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.21 
 
 
446 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42.59 
 
 
437 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 
418 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.08 
 
 
419 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.19 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  41.44 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  45.08 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  42.79 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.67 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.43 
 
 
443 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  43.31 
 
 
447 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.42 
 
 
419 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  42.86 
 
 
447 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  42.86 
 
 
447 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 
444 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
441 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  43.35 
 
 
446 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 
437 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 
437 aa  329  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  42.14 
 
 
423 aa  329  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 
421 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
452 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 
448 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 
437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  43.24 
 
 
439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  43.24 
 
 
439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  40.58 
 
 
443 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  40.52 
 
 
420 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 
443 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  43.48 
 
 
437 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  43.17 
 
 
439 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
454 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  40.46 
 
 
444 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  42.49 
 
 
440 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 
436 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  40.31 
 
 
442 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.11 
 
 
444 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 
448 aa  323  5e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 
443 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  40.98 
 
 
443 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.96 
 
 
443 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  42.75 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.96 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  42.06 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 
457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  42.13 
 
 
423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  44.15 
 
 
444 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  44.15 
 
 
444 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  44.23 
 
 
437 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  42.03 
 
 
428 aa  319  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>