More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0234 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  84.05 
 
 		 439 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  99.77 
 
 		 438 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 438 aa  857    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  73.81 
 
 		 436 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  70.11 
 
 		 439 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  69.91 
 
 		 437 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  69 
 
 		 437 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  70.54 
 
 		 446 aa  585  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  61.12 
 
 		 439 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  62.47 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  62.25 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  62.25 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  63.37 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  62.92 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  61.8 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  61.8 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  61.8 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  62.92 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.46 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.94 
 
 		 446 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 		 447 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 		 447 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.93 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.78 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  45.63 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 447 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 446 aa  349  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  45.61 
 
 		 440 aa  349  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.88 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.96 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.96 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.76 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.38 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.68 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.86 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.59 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  43.66 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  45.11 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.37 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  44.06 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  43.88 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  44.61 
 
 		 444 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  44.61 
 
 		 444 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  44.02 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  44.02 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  44.02 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  43.13 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 		 444 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  43.16 
 
 		 444 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  40.92 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  44.15 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  41.32 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  42.86 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  42.28 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  43.53 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  45.01 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.24 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  44.05 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.06 
 
 		 449 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  42.3 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  43.57 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  43.57 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  44.05 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  44.05 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42.3 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>