More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2214 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 439 aa  857    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  76.02 
 
 		 436 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  70.45 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  69.32 
 
 		 437 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  68.44 
 
 		 446 aa  597  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  70.11 
 
 		 438 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  70.11 
 
 		 438 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  69.73 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  65.61 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  64.48 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  66.97 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  64.33 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  64.33 
 
 		 439 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  64.11 
 
 		 439 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  66.82 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  63.21 
 
 		 439 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  63.21 
 
 		 439 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  63.21 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  46.04 
 
 		 423 aa  362  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  44.15 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  43.93 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  44.52 
 
 		 447 aa  348  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  44.52 
 
 		 447 aa  348  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.92 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.84 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  44.52 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  44.1 
 
 		 448 aa  343  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  44.79 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  42.21 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.06 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  42.27 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  42.36 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.06 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  46.81 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.19 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.61 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  46.72 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  46.57 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  42.33 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  46.57 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  46.81 
 
 		 437 aa  336  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.43 
 
 		 443 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.43 
 
 		 443 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  41.82 
 
 		 419 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.95 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.32 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.9 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.28 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 447 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  46.57 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.13 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  43.93 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  40.84 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.67 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  45.74 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  45.83 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  44.21 
 
 		 440 aa  329  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.56 
 
 		 449 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  46.34 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  41.22 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 446 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  44.26 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  43.39 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.89 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  43.03 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  42.96 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  45.97 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  41.27 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  41.44 
 
 		 454 aa  321  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>