More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0709 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  93.14 
 
 		 437 aa  801    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 437 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  70.45 
 
 		 439 aa  615  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  72.95 
 
 		 436 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  70.69 
 
 		 446 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  70.14 
 
 		 438 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  69.91 
 
 		 438 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  70.65 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  62.27 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  62.5 
 
 		 439 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  60.68 
 
 		 439 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  62.95 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  60.68 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  60.45 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  60.82 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  61.82 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  60.82 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  60.36 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  43.75 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 		 435 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 447 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  43.36 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  42.03 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  44.79 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.36 
 
 		 447 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.3 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  45.13 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 		 435 aa  328  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  44.13 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  42.15 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 		 435 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.67 
 
 		 445 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.21 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42.32 
 
 		 437 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.39 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.53 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.4 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.4 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  42.15 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  42.07 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  41.22 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  41.31 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  41.31 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  44.8 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  44.8 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  41.4 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  44.61 
 
 		 437 aa  318  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  41.99 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  45.1 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.75 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  45.17 
 
 		 419 aa  317  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  39.55 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  43.9 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  43.86 
 
 		 421 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  41.78 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  40.68 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  39.63 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  41.25 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.03 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.56 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  42.65 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>