More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1310 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
436 aa  851    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  76.02 
 
 
439 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  74.89 
 
 
446 aa  625  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  72.5 
 
 
437 aa  621  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  72.95 
 
 
437 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  73.81 
 
 
438 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  73.81 
 
 
438 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  76.07 
 
 
439 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  61.14 
 
 
439 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16601  preprotein translocase subunit SecY  60.68 
 
 
439 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19851  preprotein translocase subunit SecY  60.23 
 
 
439 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.517194  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1111  preprotein translocase subunit SecY  60.23 
 
 
439 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0358  preprotein translocase subunit SecY  63.04 
 
 
439 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.932904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1973  preprotein translocase subunit SecY  62.73 
 
 
439 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.962751  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17221  preprotein translocase subunit SecY  59.77 
 
 
439 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  59.09 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  58.48 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17471  preprotein translocase subunit SecY  58.86 
 
 
439 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.77971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.87 
 
 
445 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  46.28 
 
 
447 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  46.28 
 
 
447 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  46.28 
 
 
447 aa  362  6e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.38 
 
 
447 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  45.81 
 
 
446 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  45.03 
 
 
445 aa  359  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 
447 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 
448 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.39 
 
 
437 aa  359  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 
435 aa  359  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
446 aa  358  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  45.39 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.56 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.81 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  45.17 
 
 
423 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 
437 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  47.51 
 
 
447 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.42 
 
 
435 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 
443 aa  350  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 
442 aa  350  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 
441 aa  349  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  42.76 
 
 
444 aa  348  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
435 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
443 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.49 
 
 
442 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 
444 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 
437 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 
437 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
435 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 
435 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 
424 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.55 
 
 
443 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  44 
 
 
418 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 
437 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
443 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  44.66 
 
 
437 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  41.88 
 
 
420 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.24 
 
 
443 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.26 
 
 
446 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
419 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  44.79 
 
 
421 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 
444 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
446 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  45.22 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.55 
 
 
443 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 
443 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  45.22 
 
 
446 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  45.07 
 
 
439 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 
446 aa  340  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.55 
 
 
443 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  45.22 
 
 
446 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 
435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  45.97 
 
 
436 aa  339  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  45.39 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.62 
 
 
438 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  45.69 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  45.69 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  45.69 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  41.88 
 
 
419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  45.24 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 
448 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  45.69 
 
 
446 aa  336  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 
436 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 
453 aa  335  7e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  46.23 
 
 
439 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  46.23 
 
 
439 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  45.69 
 
 
446 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  44.73 
 
 
446 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  44.76 
 
 
437 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  44.81 
 
 
435 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  45.89 
 
 
439 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 
440 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.3 
 
 
435 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
446 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>