More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0787 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
438 aa  881    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  45.58 
 
 
446 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 
435 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 
437 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0509  preprotein translocase subunit SecY  44.31 
 
 
434 aa  360  3e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.96 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 
447 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 
447 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 
447 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
435 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 
437 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  40.45 
 
 
435 aa  349  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.86 
 
 
443 aa  348  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.4 
 
 
429 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 
437 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 
443 aa  345  7e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.4 
 
 
437 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.15 
 
 
435 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
420 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44 
 
 
424 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 
437 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  40.48 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42.03 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.52 
 
 
448 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  41.06 
 
 
438 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.68 
 
 
435 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.1 
 
 
442 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  42.4 
 
 
426 aa  332  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.52 
 
 
428 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.39 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 
437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 
442 aa  326  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 
441 aa  326  6e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 
431 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 
443 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 
443 aa  323  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 
443 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  38.67 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 
443 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  42.35 
 
 
418 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  41.07 
 
 
429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  39.55 
 
 
440 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 
440 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  42.2 
 
 
435 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  41.31 
 
 
427 aa  316  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 
437 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  40.64 
 
 
443 aa  316  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  40.33 
 
 
434 aa  315  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  41.91 
 
 
429 aa  315  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
446 aa  315  9e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  38.91 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  38.95 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  37.64 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  39.53 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  40.92 
 
 
421 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  38.41 
 
 
419 aa  312  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  40.85 
 
 
437 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  40.18 
 
 
448 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 
441 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  39.73 
 
 
445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  40.65 
 
 
446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  38.8 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  40.47 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  40.27 
 
 
447 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  41.61 
 
 
445 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  40.96 
 
 
435 aa  310  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  41 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  40.6 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  40.28 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  37.88 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  40.6 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  43.16 
 
 
430 aa  307  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  39.21 
 
 
437 aa  307  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  38.91 
 
 
438 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  40.65 
 
 
453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  40.27 
 
 
439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  38.41 
 
 
446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  39.37 
 
 
448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  38.98 
 
 
446 aa  306  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  40.84 
 
 
443 aa  306  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  40 
 
 
444 aa  306  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  40.51 
 
 
421 aa  306  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.26 
 
 
429 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  38.27 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>