234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3981 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 301 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  59.66 
 
 		 311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  59.32 
 
 		 302 aa  330  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  57.61 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  56.74 
 
 		 311 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  56.84 
 
 		 300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  49.49 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  56.84 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  56.9 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  48.46 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  51.64 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.82 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.39 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  26.41 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  29.33 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  28.98 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  27.95 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 424 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.33 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  25 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  25.45 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  26.85 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  25.09 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  27.56 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  22.34 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  24.1 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  26.56 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.41 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  19.87 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  22.03 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  23.18 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.32 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  23.9 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  21.33 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.26 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  26.37 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  23.1 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  25.84 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.49 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  24.07 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  23.4 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24.35 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  23 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.61 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  23.4 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  23.4 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  24.03 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  25.81 
 
 		 445 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 441 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  23 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  22.95 
 
 		 443 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  23 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  30.69 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  23 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.57 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  27.82 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  24.44 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  30.69 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  30.69 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  23.39 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  23.74 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  25.35 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  23.2 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  23.2 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  34.21 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  23.31 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  20.85 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  21.83 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  22.81 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  23.2 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 436 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  23.2 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  23.2 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  24.21 
 
 		 436 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  26.92 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 439 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  24.82 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  28.57 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.79 
 
 		 538 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.61 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>