12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2400 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  159  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  72.46 
 
 		 329 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  57.14 
 
 		 301 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  50 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  49.21 
 
 		 313 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  53.97 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  47.62 
 
 		 311 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  50.79 
 
 		 294 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  52.38 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  45.31 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  55.56 
 
 		 301 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  47.62 
 
 		 300 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>