98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5294 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  100 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  94.31 
 
 		 300 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  68.14 
 
 		 311 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  68 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  68.6 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  66.42 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  56.84 
 
 		 301 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  67.47 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  56.83 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  47.84 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  50.18 
 
 		 294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  47.62 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.99 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  27.08 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  22.55 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  22.1 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  24.61 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  24.61 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.48 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.84 
 
 		 411 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  23.68 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  21.38 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  27 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.4 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.45 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  28.12 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  25.69 
 
 		 525 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  25.69 
 
 		 525 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.67 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 447 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.6 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  29.21 
 
 		 425 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.25 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  29.39 
 
 		 452 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  28.36 
 
 		 445 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  21.84 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  23.97 
 
 		 427 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 499 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 377 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  23.91 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  21.31 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  22.63 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  22.66 
 
 		 538 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  40.96 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  21.89 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  22.87 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  22.01 
 
 		 405 aa  45.8  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  24.12 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  23.21 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  29.33 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.2 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  22.71 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  22.7 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 406 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  21.55 
 
 		 449 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  29.3 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  23.3 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  23.3 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  22.22 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  23.3 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  24.66 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 427 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  23.3 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  23.3 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  21.82 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  25.45 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  21.15 
 
 		 347 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.33 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  22.43 
 
 		 446 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 		 401 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  22.05 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  22.81 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  24.81 
 
 		 442 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  22.34 
 
 		 397 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  24.13 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  29.3 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  24.13 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  29.3 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>