194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1764 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  100 
 
 		 313 aa  617  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  66.78 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  67.57 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  63.76 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  64.54 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  57.4 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  66.18 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  69.42 
 
 		 301 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  60.22 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  47.39 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  51.61 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  26.96 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  49.21 
 
 		 80 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  29.32 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.35 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.82 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  24.13 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  26.24 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  25.28 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  24.26 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  24.92 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  26.2 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  24.92 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  24.92 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  24.92 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  24.67 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  24.05 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  24.81 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.52 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.77 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.69 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  21.04 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.44 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  26.35 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.38 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  28.97 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  25.74 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 443 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  30.83 
 
 		 445 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  34.67 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  26.18 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.92 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  27.59 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.91 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  26.53 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  25.95 
 
 		 451 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 436 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  24.16 
 
 		 367 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  23.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  23.99 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  27.15 
 
 		 436 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  25.19 
 
 		 442 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 		 442 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  25.25 
 
 		 446 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 442 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.03 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  33.08 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  24.16 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 453 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  24.64 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  22.14 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 422 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  32 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.05 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.12 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.79 
 
 		 538 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>