96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1313 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  100 
 
 		 300 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  94.31 
 
 		 300 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  67.12 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  68.33 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  67.92 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  64.54 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  56.84 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  65.74 
 
 		 301 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  56.12 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  47.87 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  51.77 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  45.31 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.57 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  28.24 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.84 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  28.73 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25.96 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  20.92 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.97 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  23.16 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  23.32 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.1 
 
 		 320 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  26.56 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  21.88 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.4 
 
 		 525 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  20.71 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  24.74 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  26.2 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  23.41 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  22.8 
 
 		 525 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 447 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  29.03 
 
 		 425 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 424 aa  49.3  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  22.96 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  28.43 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.26 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 427 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  28.46 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 499 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  23.37 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  38.46 
 
 		 422 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  23.78 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  22.85 
 
 		 538 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  22.71 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  24.58 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  23.36 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  27.57 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  24.5 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  21.68 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  22.87 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  22.9 
 
 		 449 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.33 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.67 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  21.45 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 439 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  19.85 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  21.71 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  26.07 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  22.83 
 
 		 446 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  24.55 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  24.05 
 
 		 449 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1360  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 406 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116545  normal  0.0156446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5735  membrane protein-like protein  24.92 
 
 		 379 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 453 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>