203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2719 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  51.2 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  55 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  51.06 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  50.53 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  48.46 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  47.95 
 
 		 311 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  51.77 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  50.91 
 
 		 300 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  46.13 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  51.41 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.45 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  26.82 
 
 		 412 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  29.64 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  26.44 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  50.79 
 
 		 80 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  26.16 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  24.55 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  29.34 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.47 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.95 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.86 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.31 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  24.38 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.86 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  26.89 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  29.92 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  26.86 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  23.71 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  23.84 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  25.57 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  21.43 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.5 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  26.36 
 
 		 442 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  25.71 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.09 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  21.71 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  24.34 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.08 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  27.73 
 
 		 443 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.08 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.08 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.9 
 
 		 416 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.78 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.78 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  26.78 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  26.78 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  26.78 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  24.28 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.9 
 
 		 499 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1593  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.949461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  23.57 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  26.89 
 
 		 443 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  23.22 
 
 		 422 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>