139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0234 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  100 
 
 		 296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  61.15 
 
 		 311 aa  324  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  58.33 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  60.43 
 
 		 313 aa  311  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  57.09 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  56.12 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  50.71 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  56.83 
 
 		 300 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  59.21 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  47.35 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  43.02 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  26.45 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.36 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  27.61 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25.76 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  23.25 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.37 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  26.38 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  26.45 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  21.84 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  28.57 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.79 
 
 		 525 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  29.08 
 
 		 445 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.79 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 441 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  29.3 
 
 		 427 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  20.96 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 429 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 499 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  23.96 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  23.2 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  24.06 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  26.33 
 
 		 447 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  26.53 
 
 		 453 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  27.08 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  27.43 
 
 		 429 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  22.85 
 
 		 538 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  23.68 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  20.9 
 
 		 424 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  25 
 
 		 439 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  27.85 
 
 		 433 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 403 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.17 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.56 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.03 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  22.15 
 
 		 449 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  23.51 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 428 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25.54 
 
 		 416 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  24.14 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 		 450 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  23.76 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  24.43 
 
 		 397 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  24.26 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.63 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.61 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>