192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3753 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3753  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335404  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1147  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  59.06 
 
 
196 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467431  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3173  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  55.64 
 
 
133 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5718  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  45.24 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0871  heat shock protein, Hsp20 family  41.27 
 
 
134 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0996  heat shock protein Hsp20  41.27 
 
 
134 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000618844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3005  hypothetical protein  40.3 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.15 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.29 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.79 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.79 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  26.23 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  32.63 
 
 
141 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  24.73 
 
 
189 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  25.81 
 
 
189 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
189 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
156 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
138 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  32.98 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  28.32 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  32.39 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  33.8 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
228 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  25.53 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  25.53 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  31.87 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  28.43 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
150 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  28.81 
 
 
137 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.99 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  29.79 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  31.91 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  23.96 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2207  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.540832  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  31.11 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  25 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  32.05 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  27.14 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  31.51 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  27.82 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  29.69 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  35.79 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  27.82 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  27.82 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>