291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0996 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0871  heat shock protein, Hsp20 family  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0996  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000618844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5718  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  50.4 
 
 
134 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3173  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  39.69 
 
 
133 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3005  hypothetical protein  40.77 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3753  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335404  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1147  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  40.91 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467431  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.33 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
195 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  25.96 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
189 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
230 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.29 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  26.85 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.75 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  30.49 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  29.17 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  30.49 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
189 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  27.93 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.21 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.29 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  27.17 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
228 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  27.06 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.09 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  30.56 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  29.49 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  25.78 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.38 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.38 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
176 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  34.38 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  28.12 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  25.24 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  28.42 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  24.74 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  25.83 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  26.45 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  25.47 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1100  heat shock protein Hsp20  34.57 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000430897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
143 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  28.45 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  24 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  23.21 
 
 
158 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  22.9 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  27.64 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 
176 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  25.74 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  25 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  27.78 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  25.24 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  25.51 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  25 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  30.26 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  30.23 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>