210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3005 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3005  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3173  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  44.7 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0996  heat shock protein Hsp20  40.77 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000618844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0871  heat shock protein, Hsp20 family  40.77 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3753  hypothetical protein  40.3 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5718  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  40.32 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1147  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  42.52 
 
 		 196 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467431  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.46 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.21 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.71 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 189 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.79 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  29.84 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  27.73 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  27.73 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1100  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000430897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  32 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  26.88 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  25.83 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30.53 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  26.37 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.72 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  28.89 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.35 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  23.64 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  29.35 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  26.6 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  26.6 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0537  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  24.37 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  32.98 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  35.87 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  27.88 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  24.37 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  27.55 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  25.98 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  29.31 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  27.59 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  26.88 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  33 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  26 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  23.81 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  30.85 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  26.89 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>