More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0128 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3289  ATP-dependent DNA helicase REP protein  51.9 
 
 		 705 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.35 
 
 		 695 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3158  UvrD/REP helicase  51.9 
 
 		 706 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154088  normal  0.513844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0721  UvrD/REP helicase  68.21 
 
 		 701 aa  931    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3327  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.33 
 
 		 704 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0992503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.35 
 
 		 733 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  50.28 
 
 		 695 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 721 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0339  UvrD/REP helicase  74.93 
 
 		 687 aa  983    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.07 
 
 		 848 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.35 
 
 		 695 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  69.93 
 
 		 716 aa  964    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  49.72 
 
 		 696 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0128  putative ATP-dependent DNA helicase rep protein  100 
 
 		 693 aa  1400    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570689  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  65.61 
 
 		 689 aa  884    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3478  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.13 
 
 		 695 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  50.5 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  69.05 
 
 		 709 aa  969    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0554  UvrD/REP helicase  64.49 
 
 		 705 aa  877    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  50.07 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3485  UvrD/REP helicase  51.76 
 
 		 706 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  49.72 
 
 		 696 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  63.65 
 
 		 697 aa  857    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  50.5 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  65.61 
 
 		 689 aa  882    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  49.86 
 
 		 731 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  50.07 
 
 		 695 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  50.5 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  66.28 
 
 		 689 aa  914    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1535  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.28 
 
 		 700 aa  635  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  50.87 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3002  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.28 
 
 		 700 aa  635  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.01 
 
 		 663 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3067  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.28 
 
 		 700 aa  635  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3303  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.28 
 
 		 700 aa  635  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.02 
 
 		 660 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  49.28 
 
 		 690 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  45.36 
 
 		 677 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.36 
 
 		 662 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  45.7 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  46.36 
 
 		 662 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.44 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.26 
 
 		 671 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.99 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  44.44 
 
 		 671 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.47 
 
 		 671 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.02 
 
 		 670 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.82 
 
 		 670 aa  525  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.02 
 
 		 670 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.02 
 
 		 670 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.87 
 
 		 670 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.02 
 
 		 685 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  45.66 
 
 		 685 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.43 
 
 		 665 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.27 
 
 		 671 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.96 
 
 		 670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4325  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.48 
 
 		 671 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.74 
 
 		 669 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.28 
 
 		 665 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  44.69 
 
 		 669 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  43.94 
 
 		 668 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.48 
 
 		 671 aa  515  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.71 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.7 
 
 		 673 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.35 
 
 		 682 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.18 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.18 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.96 
 
 		 672 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.87 
 
 		 671 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.37 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.75 
 
 		 667 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.18 
 
 		 670 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3599  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.87 
 
 		 670 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  44.95 
 
 		 669 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.37 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.37 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.08 
 
 		 674 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.35 
 
 		 669 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.08 
 
 		 674 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.08 
 
 		 674 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.56 
 
 		 674 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.78 
 
 		 673 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  44.17 
 
 		 688 aa  505  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.16 
 
 		 669 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.08 
 
 		 674 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.08 
 
 		 707 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.18 
 
 		 670 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.71 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.67 
 
 		 669 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.07 
 
 		 672 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0406  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.18 
 
 		 670 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4147  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.02 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0515139  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.33 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.33 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  45.33 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.97 
 
 		 677 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.33 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.84 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.33 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.8 
 
 		 669 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>