More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3289 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3289  ATP-dependent DNA helicase REP protein  100 
 
 		 705 aa  1458    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1535  ATP-dependent DNA helicase Rep  77.65 
 
 		 700 aa  1095    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3002  ATP-dependent DNA helicase Rep  77.65 
 
 		 700 aa  1095    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  59.86 
 
 		 663 aa  798    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0128  putative ATP-dependent DNA helicase rep protein  52.07 
 
 		 693 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570689  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3327  ATP-dependent DNA helicase Rep  84.16 
 
 		 704 aa  1234    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0992503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  59.94 
 
 		 660 aa  777    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  78.35 
 
 		 695 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  78.16 
 
 		 733 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  76.92 
 
 		 695 aa  1107    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  77.64 
 
 		 695 aa  1108    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  78.16 
 
 		 848 aa  1117    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  77.49 
 
 		 695 aa  1110    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3158  UvrD/REP helicase  95.32 
 
 		 706 aa  1403    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154088  normal  0.513844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  75.78 
 
 		 696 aa  1098    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  60.14 
 
 		 690 aa  820    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  76.21 
 
 		 696 aa  1103    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3478  ATP-dependent DNA helicase Rep  83.45 
 
 		 695 aa  1223    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  57.89 
 
 		 663 aa  780    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  77.49 
 
 		 695 aa  1110    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  77.73 
 
 		 721 aa  1117    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  78.35 
 
 		 695 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  51.4 
 
 		 689 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0721  UvrD/REP helicase  51.87 
 
 		 701 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  77.35 
 
 		 695 aa  1109    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3485  UvrD/REP helicase  95.46 
 
 		 706 aa  1408    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  77.03 
 
 		 731 aa  1109    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3303  ATP-dependent DNA helicase Rep  77.65 
 
 		 700 aa  1095    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  77.49 
 
 		 695 aa  1110    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3067  ATP-dependent DNA helicase Rep  77.65 
 
 		 700 aa  1095    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  50.14 
 
 		 697 aa  626  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  51.04 
 
 		 689 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  48.96 
 
 		 709 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  51.04 
 
 		 689 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  48.18 
 
 		 716 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0339  UvrD/REP helicase  50.15 
 
 		 687 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0554  UvrD/REP helicase  49.79 
 
 		 705 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  49.02 
 
 		 677 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  48.51 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.51 
 
 		 671 aa  594  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.04 
 
 		 671 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.21 
 
 		 674 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.68 
 
 		 675 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.62 
 
 		 673 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.62 
 
 		 673 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.48 
 
 		 673 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.78 
 
 		 674 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.7 
 
 		 670 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.68 
 
 		 673 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.86 
 
 		 670 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.46 
 
 		 670 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.46 
 
 		 685 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.46 
 
 		 670 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  47.44 
 
 		 673 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.44 
 
 		 673 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.44 
 
 		 670 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.44 
 
 		 673 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.17 
 
 		 670 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  49.55 
 
 		 671 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  47.44 
 
 		 673 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.44 
 
 		 673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  46.65 
 
 		 671 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.44 
 
 		 673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.44 
 
 		 673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.3 
 
 		 673 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.44 
 
 		 673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3599  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.31 
 
 		 670 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.16 
 
 		 671 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.82 
 
 		 674 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.82 
 
 		 674 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.82 
 
 		 674 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.53 
 
 		 665 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.82 
 
 		 674 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.07 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.93 
 
 		 672 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.31 
 
 		 669 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.27 
 
 		 670 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.49 
 
 		 674 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.84 
 
 		 677 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4325  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.74 
 
 		 671 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.53 
 
 		 665 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.61 
 
 		 673 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4147  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.7 
 
 		 670 aa  571  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0515139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0406  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.44 
 
 		 670 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.56 
 
 		 707 aa  572  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.77 
 
 		 671 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.42 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.32 
 
 		 671 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.32 
 
 		 671 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.91 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  46.32 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  47.77 
 
 		 668 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.02 
 
 		 667 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  45.48 
 
 		 662 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.48 
 
 		 662 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.74 
 
 		 682 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.81 
 
 		 672 aa  548  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.29 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  45.31 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.17 
 
 		 669 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>