45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1545 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  100 
 
 		 398 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  62.91 
 
 		 402 aa  511  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  58.6 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  59.64 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  51.18 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  45.36 
 
 		 402 aa  340  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  45.92 
 
 		 461 aa  335  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  46.09 
 
 		 517 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  36.3 
 
 		 499 aa  253  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  36.78 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  35.41 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  34.85 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  35.37 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  34.74 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  35.03 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  33.95 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  33.94 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  33.15 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  34.38 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  33.16 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  33.42 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  34.96 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  32.98 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  33.42 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  31.1 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  34.67 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  32.02 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  31.71 
 
 		 404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  32.09 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  30.87 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  31.66 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  37.3 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  38.02 
 
 		 603 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  36.9 
 
 		 629 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  32.45 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  47.14 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  35.4 
 
 		 243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  29.31 
 
 		 221 aa  94  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  29.73 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  27.12 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  27.52 
 
 		 539 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  28.68 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  29.33 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  25.66 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  31.47 
 
 		 477 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>