24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0574 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  100 
 
 		 539 aa  1046    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  39.62 
 
 		 499 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  35.16 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  38.92 
 
 		 523 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  48.09 
 
 		 589 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  43.62 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  30.38 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  30.54 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  29.08 
 
 		 398 aa  93.2  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  27.27 
 
 		 517 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  29.91 
 
 		 402 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  30.13 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  27.52 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  27.12 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  23.88 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  23.88 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  23.13 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  24.11 
 
 		 380 aa  56.2  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  24.29 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  25.21 
 
 		 390 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  23.14 
 
 		 396 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  27.7 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  23.14 
 
 		 404 aa  46.2  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  33.07 
 
 		 265 aa  44.3  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>