46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0242 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  100 
 
 
393 aa  775    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  59.38 
 
 
380 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  57.58 
 
 
380 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  59.13 
 
 
380 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  59.64 
 
 
380 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  35.99 
 
 
402 aa  230  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  38.95 
 
 
461 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  34.36 
 
 
396 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  36.94 
 
 
517 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  35.04 
 
 
398 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  35.71 
 
 
403 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  33.67 
 
 
404 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  33.78 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  31.32 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  33.51 
 
 
402 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  34.04 
 
 
392 aa  199  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  33.95 
 
 
390 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  34.35 
 
 
423 aa  195  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  35.03 
 
 
398 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  34.54 
 
 
401 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  34.13 
 
 
390 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  36.04 
 
 
404 aa  189  1e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  35.82 
 
 
387 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  33.08 
 
 
401 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  32.12 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  31.9 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  32.28 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  32.02 
 
 
405 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  29.41 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  31.7 
 
 
410 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  30.97 
 
 
406 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  35.56 
 
 
243 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  37.32 
 
 
603 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  34.25 
 
 
499 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  35.33 
 
 
523 aa  99.4  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  37.5 
 
 
629 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  35.25 
 
 
589 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  30.99 
 
 
221 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  27.63 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  27.38 
 
 
374 aa  87  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  26.86 
 
 
256 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  23.5 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  29.41 
 
 
477 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0190  TraB determinant protein  47.27 
 
 
625 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  24.24 
 
 
539 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  25.17 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>