44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1076 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  100 
 
 		 403 aa  820    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  42.97 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  41.49 
 
 		 390 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  44.62 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  40.53 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  39.48 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  35.09 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  40.26 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  39.74 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  39.58 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  40.31 
 
 		 397 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  39.53 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  40.48 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  36.43 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  37.53 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  37.47 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  36.63 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  33.33 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  35.31 
 
 		 461 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  36.01 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  35.71 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  35.71 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  35.03 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  34.38 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  33.33 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  35.79 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  33.94 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  34.51 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  34.97 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  34.7 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  42.92 
 
 		 243 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  29.04 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  41.61 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  29.55 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  40.97 
 
 		 499 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  29.69 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  37.5 
 
 		 603 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  37.32 
 
 		 589 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  37.06 
 
 		 629 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  26.15 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  30.28 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  26.07 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  27.72 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  29.19 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>