44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2520 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  100 
 
 		 390 aa  785    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  56.59 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  46.15 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  45.16 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  45.67 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  39.48 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  38.54 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  37.27 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  37.28 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  34.25 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  37.21 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  35.19 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  33.95 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  36.34 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  35.46 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  36.8 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  34.65 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  36.62 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  34.13 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  34.62 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  36.19 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  35.41 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  34.87 
 
 		 405 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  34.23 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  35.71 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  36.56 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  35.75 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  33.95 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  32.29 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  34.4 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  33.6 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  37.44 
 
 		 243 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  36.18 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  29.91 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  28.69 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  38.89 
 
 		 499 aa  93.6  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  28.63 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  27.73 
 
 		 589 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  34.33 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  34.06 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  25.84 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  26.7 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  24.78 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  31.71 
 
 		 477 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>