44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0418 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  100 
 
 
404 aa  794    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  39.27 
 
 
396 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  35.09 
 
 
403 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  40.47 
 
 
390 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  41.12 
 
 
387 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  36.81 
 
 
392 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  37.17 
 
 
390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  34.81 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  32.32 
 
 
401 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  31.76 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  33.87 
 
 
397 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  32.91 
 
 
404 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  32.81 
 
 
404 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  29.89 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  31.12 
 
 
402 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  32.82 
 
 
398 aa  206  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  33.33 
 
 
461 aa  203  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  32.35 
 
 
410 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  33.08 
 
 
517 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  36.04 
 
 
393 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  35.28 
 
 
380 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  30.32 
 
 
405 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  32.35 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  35.71 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  30.85 
 
 
405 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  31.9 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  30.83 
 
 
406 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  34.76 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  30.15 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  30.81 
 
 
423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  34.04 
 
 
380 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  34.43 
 
 
243 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  28.62 
 
 
374 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  29.77 
 
 
452 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  34.46 
 
 
603 aa  96.3  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  27.04 
 
 
256 aa  93.6  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  32.61 
 
 
523 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  31.97 
 
 
589 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  31.03 
 
 
629 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  31.43 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  31.98 
 
 
221 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  24.68 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  25 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  25.81 
 
 
477 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>