46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38424 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  30.91 
 
 
392 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  33.72 
 
 
391 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  31 
 
 
461 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  30.84 
 
 
390 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  28.39 
 
 
390 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  27.04 
 
 
404 aa  92.8  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  29.52 
 
 
387 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  27.73 
 
 
517 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  29.57 
 
 
402 aa  88.6  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  33.53 
 
 
431 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  30.04 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  30 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  30.09 
 
 
396 aa  82.4  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  28.22 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  29.78 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  26.86 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  30.36 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  27.16 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  28.94 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  30.8 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  30.26 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  28.33 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  28.27 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  27.47 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  28.02 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  27.47 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  26.07 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  28.19 
 
 
400 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  26.34 
 
 
401 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  27.85 
 
 
397 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  29.61 
 
 
589 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  25.25 
 
 
477 aa  59.7  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  25.47 
 
 
452 aa  59.3  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  25.28 
 
 
374 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  32.31 
 
 
603 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  29.3 
 
 
499 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  28.76 
 
 
629 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  26.75 
 
 
410 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  30.07 
 
 
523 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  26.55 
 
 
406 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  25 
 
 
405 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  24.89 
 
 
405 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25928  predicted protein  39.13 
 
 
1446 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00588947 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17900  predicted protein  39.13 
 
 
1446 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0157397 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28901  predicted protein  43.48 
 
 
564 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>