25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48468 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  100 
 
 		 431 aa  875    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  32.35 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  26.32 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  26.49 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  26.45 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  25 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  26.7 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  25.83 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  27.34 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  23.08 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  27.92 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  31.58 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  25.66 
 
 		 398 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  25.93 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  30.13 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  22.73 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  27.27 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  25.15 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  25.97 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  27.63 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  28.1 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  33.33 
 
 		 589 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  24.52 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  33.33 
 
 		 629 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  25.17 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>