44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0461 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  100 
 
 		 391 aa  786    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  45.67 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  43.15 
 
 		 392 aa  329  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  43.6 
 
 		 390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  38.52 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  42.97 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  39.74 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  34.47 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  40.16 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  37.53 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  37.24 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  38.32 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  37.63 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  36.77 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  36.13 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  34.46 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  35.47 
 
 		 517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  38.21 
 
 		 410 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  35.31 
 
 		 402 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  36.84 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  38.04 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  35.17 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  34.96 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  38.06 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  35.22 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  32.24 
 
 		 380 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  31.91 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  30.48 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  31.97 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  30.41 
 
 		 380 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  32.27 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  39.91 
 
 		 243 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  32.95 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  45.07 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  41.3 
 
 		 603 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  39.26 
 
 		 629 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  39.42 
 
 		 589 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  38.85 
 
 		 499 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  29.8 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  29.6 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  26.07 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  29.05 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  28.95 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  28.83 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>