44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2875 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  100 
 
 		 404 aa  809    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  61.43 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  62.09 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  58.69 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  60.15 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  55.45 
 
 		 399 aa  431  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  42.36 
 
 		 405 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  42.37 
 
 		 410 aa  311  9e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  43.11 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  44.14 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  39.31 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  38.12 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  40.26 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  37.28 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  40.05 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  38.32 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  36.53 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  32.91 
 
 		 404 aa  219  8.999999999999998e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  37.83 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  36.15 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  33.67 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  35.32 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  35 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  33.42 
 
 		 517 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  33.25 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  32.8 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  34.03 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  31.71 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  34.2 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  33.25 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  32.17 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  32.56 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  27.44 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  34.69 
 
 		 523 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  37.59 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  38.06 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  29.03 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  29.03 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  30.8 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  35.07 
 
 		 603 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  24.88 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  26.18 
 
 		 265 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  25.15 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  26.88 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>