45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0979 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  100 
 
 		 517 aa  1043    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  60.19 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  48.71 
 
 		 402 aa  398  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  46.58 
 
 		 398 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  43.11 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  46.48 
 
 		 398 aa  335  9e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  40.38 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  43.73 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  34.82 
 
 		 499 aa  250  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  39.52 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  38.24 
 
 		 380 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  37.7 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  38.16 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  36.9 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  37.5 
 
 		 387 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  36.9 
 
 		 390 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  37.4 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  35.2 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  32.82 
 
 		 392 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  35.2 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  33.33 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  33.83 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  35.03 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  33.42 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  33.24 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  32.12 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  32.73 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  32.36 
 
 		 405 aa  167  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  38.46 
 
 		 589 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  30.75 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  32.02 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  32.82 
 
 		 406 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  31.69 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  34.62 
 
 		 629 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  35.89 
 
 		 243 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  34.65 
 
 		 603 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  46.38 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  33.08 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  31.5 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  27.76 
 
 		 256 aa  93.6  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  29.86 
 
 		 221 aa  87.4  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  27.45 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  34 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  26.99 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  25.64 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>