40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1134 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  33.18 
 
 		 461 aa  108  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  33.03 
 
 		 402 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  32.72 
 
 		 398 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  32.2 
 
 		 401 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  30.7 
 
 		 396 aa  95.9  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  29.31 
 
 		 398 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  30.99 
 
 		 393 aa  90.9  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  31.44 
 
 		 402 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  29.6 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  27.48 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  24.88 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  29.78 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  26.89 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  31.56 
 
 		 404 aa  79  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  28.7 
 
 		 380 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  29.09 
 
 		 517 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  27.8 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  26.98 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  26.15 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  26.51 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  25.13 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  27.31 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  25.84 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  32.85 
 
 		 523 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  27.83 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  26.79 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  28.3 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  33.81 
 
 		 603 aa  65.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  27.44 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  31.85 
 
 		 499 aa  61.6  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  28.3 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  24.88 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  30.88 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  30.6 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  28.77 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  24.42 
 
 		 399 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  26.11 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  21.92 
 
 		 477 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>