45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1751 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  100 
 
 		 392 aa  791    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  56.59 
 
 		 390 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  47.26 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  49.2 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  40.53 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  43.15 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  37.11 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  39.65 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  39.31 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  36.81 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  38.06 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  37.25 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  39.06 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  36.17 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  34.93 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  36.02 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  36.14 
 
 		 401 aa  222  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  35.6 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  36.78 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  36.34 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  33.6 
 
 		 517 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  34.48 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  34.92 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  32.9 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  34.04 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  34.84 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  35.5 
 
 		 410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  32.71 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  32.97 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  33.07 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  32.8 
 
 		 380 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  36.68 
 
 		 243 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  30.91 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  31.8 
 
 		 589 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  30.2 
 
 		 523 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  31.67 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  28.57 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  34.88 
 
 		 629 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  31.78 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  27.48 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  27.45 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  29.73 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  24.23 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  25.93 
 
 		 431 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46542  predicted protein  26.15 
 
 		 495 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.862981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>