40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49988 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  100 
 
 		 452 aa  918    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  94.91 
 
 		 374 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  31.14 
 
 		 396 aa  107  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  32.33 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  29.77 
 
 		 404 aa  103  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  28.57 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  30.27 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  33.08 
 
 		 517 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  28.96 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  30.47 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  28.69 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  28.42 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  27.63 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  28.57 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  27.73 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  29.89 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  28.84 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  28.29 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  26.36 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  26.16 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  26.69 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  25.52 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  28.79 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  29.03 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  25.48 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  27.12 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  24.91 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  30.37 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  29.25 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  27.24 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  29.02 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  27.67 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  25.59 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  28.46 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  25.46 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  30.13 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  26.74 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  29.75 
 
 		 629 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  26.35 
 
 		 523 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  25.47 
 
 		 603 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>