45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1586 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  100 
 
 		 402 aa  812    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  62.91 
 
 		 398 aa  511  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  60.35 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  58.75 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  48.94 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  44.81 
 
 		 461 aa  324  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  44.33 
 
 		 402 aa  311  9e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  43.48 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  35.6 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  34.76 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  34.23 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  35.56 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  35.29 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  33.51 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  35.29 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  32.18 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  33.94 
 
 		 403 aa  186  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  33.33 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  33.42 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  35.17 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  31.32 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  31.7 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  40.33 
 
 		 589 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  39.51 
 
 		 629 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  33.16 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  40.08 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  33.72 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  33.25 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  34.67 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  29.12 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  31.84 
 
 		 400 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  30.08 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  32.89 
 
 		 406 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  31.56 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  36.51 
 
 		 603 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  37.26 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  34.35 
 
 		 243 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  31.44 
 
 		 221 aa  89.7  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  28.79 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  29.91 
 
 		 539 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  30.36 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  28.29 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  30.91 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  27.27 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  27.27 
 
 		 431 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>