36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31114 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  100 
 
 
477 aa  956    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  31.33 
 
 
523 aa  70.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  35.61 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  37.98 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  37.5 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  34.59 
 
 
390 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  35.88 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  40.6 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  28.76 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  33.11 
 
 
589 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  32.5 
 
 
603 aa  63.9  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  29.15 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  27.27 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  29.41 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  33.14 
 
 
243 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  25.32 
 
 
256 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  32.69 
 
 
401 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  34.35 
 
 
396 aa  60.1  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  29.73 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  31.71 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  33.33 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  31.01 
 
 
629 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  27.14 
 
 
380 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  29.08 
 
 
423 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  27.14 
 
 
380 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  27.14 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  32.35 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  31.47 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  33.33 
 
 
387 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  29.73 
 
 
401 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  36.36 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  30.53 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  26.6 
 
 
404 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  25.81 
 
 
404 aa  47  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  26.88 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  26.29 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>