43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00884 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  100 
 
 		 406 aa  810    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  76.46 
 
 		 405 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  76.01 
 
 		 405 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  74.38 
 
 		 410 aa  592  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  44.14 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  46.78 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  45.11 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  45.75 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  45.18 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  43.19 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  36.62 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  35.09 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  35.71 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  33.59 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  34.84 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  39.67 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  36.55 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  30.21 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  30.97 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  32.82 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  31.89 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  32.89 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  32.51 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  34.19 
 
 		 401 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  34.21 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  32.45 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  31.62 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  32.98 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  31.08 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  29.09 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  29.76 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  33.18 
 
 		 243 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  30.34 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  38.62 
 
 		 523 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  37.68 
 
 		 603 aa  83.2  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  37.5 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  38.81 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  28.85 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  28.46 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  28.77 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  31 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  35.76 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  27.63 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>