44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0860 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  100 
 
 		 603 aa  1175    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  53.75 
 
 		 499 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  50.85 
 
 		 589 aa  519  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  50.93 
 
 		 629 aa  519  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  52.29 
 
 		 523 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  35.82 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  39.45 
 
 		 401 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  38.27 
 
 		 398 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  38.02 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  36.51 
 
 		 402 aa  164  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  50 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  36.03 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  33.97 
 
 		 423 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  35.42 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  42.5 
 
 		 396 aa  107  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  41.3 
 
 		 391 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  36.36 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  34.23 
 
 		 404 aa  97.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  33.77 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  34.59 
 
 		 380 aa  94.7  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  39.31 
 
 		 387 aa  94  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  38.75 
 
 		 410 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  34.09 
 
 		 380 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  33.83 
 
 		 380 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  34.85 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  38.58 
 
 		 243 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  37.2 
 
 		 400 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  29.24 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  34.33 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  37.32 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  34.33 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  36.73 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  29.02 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  34.03 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  32.19 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  36.43 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  35.04 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  27.11 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  33.81 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  32.5 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  37.5 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  32.31 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  32.64 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  25.47 
 
 		 374 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>