43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1603 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  97.04 
 
 		 405 aa  778    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  100 
 
 		 405 aa  820    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  76.2 
 
 		 406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  69.87 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  45.06 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  42.36 
 
 		 404 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  45.09 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  44.19 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  42.82 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  43.44 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  37.47 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  35.26 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  34.87 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  34.5 
 
 		 396 aa  223  7e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  34.48 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  37.03 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  36.84 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  28.86 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  33.42 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  33.16 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  32.28 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  32.36 
 
 		 517 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  31.7 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  30.71 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  30.57 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  31.69 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  32.8 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  29.27 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  29.92 
 
 		 380 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  29.6 
 
 		 380 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  28.61 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  28.93 
 
 		 243 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  26.74 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  37.06 
 
 		 523 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  38.69 
 
 		 629 aa  87  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  30.58 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  34.78 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  28.67 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  30 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  28.3 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  28.46 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  30.15 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  23.56 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>