44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1639 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  100 
 
 		 410 aa  817    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  74.38 
 
 		 406 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  69.37 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  69.87 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  46.85 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  42.37 
 
 		 404 aa  323  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  46.37 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  43.46 
 
 		 397 aa  302  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  43.39 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  40.9 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  36.22 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  36.63 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  35.75 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  34.65 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  40.05 
 
 		 387 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  37.47 
 
 		 391 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  35.5 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  31.9 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  37.34 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  34.67 
 
 		 398 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  34.63 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  34.88 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  31.7 
 
 		 393 aa  186  9e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  34.67 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  30.75 
 
 		 517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  35.47 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  32.61 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  30.15 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  32.26 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  32.24 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  29.4 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  31.38 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  42.76 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  41.67 
 
 		 629 aa  99.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  40 
 
 		 589 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  38.46 
 
 		 603 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  41.61 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  30.37 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  30.19 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  32.49 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  27.83 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  35.29 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  27.35 
 
 		 256 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  27.63 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>